Популяризация

Институт биоинформатики разрабатывает и реализует разнообразные форматы мероприятий по распространению научных знаний для широкой аудитории.
DETAILS
Подробности
Здесь вы можете познакомиться с нашими направлениями популяризации биоинформатики

Мероприятия

хакатон BioHack, международная онлайн-олимпиада Bioinformatics Contest и
гостевые лекции
Ресурсы

биоинформатический чат BioHub
Материалы

зачем и где изучать биоинформатику в России и где потом работать
Гостевые лекции
В Институте биоинформатики в рамках обучения организуются тематические гостевые лекции с приглашенными экспертами. Большинство из них являются открытыми для широкой публики. Для того чтобы зарегистрироваться, необходимо зайти на страницу грядущей лекции и заполнить форму.

Если вы хотите выступить в Институте биоинформатики в Санкт-Петербурге с открытой гостевой лекцией, пожалуйста, заполните эту форму.
Хакатон по биоинформатике | BioHack
BioHack — хакатон для команд биологов и программистов по решению прикладных задач в области биоинформатики в течение 48 часов.

Цели хакатона
  • популяризация биоинформатики в России;
  • междисциплинарное общение молодых специалистов технических и биологических направлений;
  • формирование биоинформатического сообщества в Санкт-Петербурге;
  • развитие перспективных идей и IT-решений в области биологии и современной медицины.

Подробности
  • хакатон длится 48 часов: с пятницы по воскресенье;
  • размер команд от 3 до 5 человек;
  • окончательное распределение по командам — в день открытия хакатона после презентаций проектов;
  • организаторы обеспечат всех участников полноценным питанием, комфортными условиями для работы и круглосуточный доступ к площадке.
Хакатон впервые прошел 3-5 марта 2017 года. Следующий хакатон запланирован на март 2018 года.

Онлайн-олимпиада по биоинформатике | Bioinformatics Contest
Институт биоинформатики совместно со Stepik и Rosalind, при участии студентов и выпускников Университета ИТМО, впервые в начале 2017 года провел онлайн-соревнование по программированию в решении биоинформатических задач.

Для участия требуются навыки программирования на любом языке, а также знание биологии/биоинформатики/геномики.
Чат для биоинформатиков | BioHub
Это чат в реальном времени, где можно обмениваться информацией в общих каналах, закрытых группах или тет-а-тет.

В BioHub можно обсуждать все темы, связанные с биоинформатикой, задавать вопросы, создавать новые каналы, делиться полезными ссылками и общаться с другими членам сообщества!

Зарегистрироваться и начать общаться — slack.bioinf.me
Зачем изучать биоинформатику
Современная биология имеет дело с гигантскими объемами данных, к которым старые методы либо неприменимы, либо им просто не справиться с задачей их обработки. Здесь и приходит на помощь биоинформатика. В общем смысле, биоинформатика - это использование компьютерных, математических и статистических методов для решения биологических задач. Сейчас биологические исследования очень разнообразны, появился целый ряд новых наук, так называемых "омик" (геномика, транскриптомика, протеомика, метаболомика и другие), многие из которых уже заняли место в современной биологии. Также существуют и совсем междисциплинарные научные направления, например, такая область как системная биология. Она ставит целью объединить всё в единую картину, изучая и моделируя взаимодействия в живых системах. Биоинформатика, как и биология, имеет довольно широкий разброс методов и разделов.

Если вы биолог, то, наверняка, уже столкнулись или вскоре столкнетесь с задачей, для решения которой нужна биоинформатика, например:
  • сборка генома
  • нахождение и изучение функций генов
  • предсказание экспрессии генов
  • предсказание функций белков
  • поиск геномных вариантов и ассоциированных с ними фенотипов
  • неонатальная диагностика на генетические заболевания
  • вопросы эволюционной и сравнительной биологии, моделирование эволюции
  • и даже разработка лекарств
Изучая биоинформатику, помимо практических навыков программирования, статистического анализа, обработки данных и визуализации результатов, биологи могут начать общаться на одном языке с техническими специалистами, грамотно ставить задачи, проверять полученные решения и работать более эффективно вместе с программистами и математиками над улучшением и созданием удобных и простых в обращении биоинформатических программ.

Для информатиков и математиков биоинформатика - это возможность:
  • приложить знания Сomputer Science к интереснейшей и обширной предметной области - медицине, биологии и эволюции
  • решать интересные и сложные алгоритмические задачи
  • создавать программные инструменты для биологов и медиков
  • быть полезными и применять свои знания для решения важнейших задач человечества, связанных со здоровьем, качеством и продолжительностью жизни людей
  • сделать реальный вклад в развитие наук о жизни в целом
И тем и другим, биоинформатика помогает значительно ускорить профессиональный рост, а также интересные, сложные и нетривиальные научные задачи.

Полезно почитать

Если интересно

Некоторые лекции и курсы

Образовательные программы по биоинформатике
Специалитет
Москва МГУ (факультет биоинженерии и биоинформатики)
Новосибирск НГУ (факультет eстественных наук, кафедра информационной биологии)
Cаратов СГУ (факультет биологии, специальность биоинформатика и биоинженерия)
Санкт-Петербург СПбАУ РАН

Магистратура
Москва
МФТИ (факультет молекулярной и биологической физики, кафедра биоинформатики)
Магистерская программа "Биомедицинские науки и технологии", Сколковский институт науки и технологий
ВШЭ «Анализ данных в биологии и медицине»
РНИМУ им. Пирогова Кафедра биоинформатики, медико-биологический факультет

Санкт-Петербург
СПбАУ РАН (кафедра математических и информационных технологий)
СПбГПУ (физико-механический факультет, кафедра прикладной математики)

Нижний Новгород
ННГУ (факультет вычислительной математики и кибернетики, кафедра биоинформатики)

Казань
Кафедра биоинформатики и медицинской кибернетики, институт фундаментальной медицины и биологии КФУ

Калининград
Институт живых систем, Биоинженерия и биоинформатика, БФУ им. И. Канта

Волгоград
Кафедра биоинженерии и биоинформатики, институт приоритетных технологий ВолГУ

Саратов
Специальность биоинженерия и биоинформатика, биологический факультет СГУ

Новосибирск
Кафедра информационной биологии, факультет естественных наук НГУ

Дополнительное образование
Москва Школа Биоинформатики
Санкт-Петербург Институт биоинформатики

Школьникам
Города России Фестиваль науки
Москва МГУ, Лагерь по биоинформатике
Петрозаводск ПетрГУ, Научно-проектная лаборатория «Илмаринен»
Компании и лаборатории
Россия
Иркутск
Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук» http://www.bionet.nsc.ru/

Москва
Skolkovo Institute of Sciences and Technology (SkolTech) http://www.skoltech.ru
Personalbiomed http://personalbiomed.ru/
Геномед http://www.genomed.ru/
ЗАО «Геноаналитика» http://genoanalytica.ru/
Первый Онкологический Научно-консультационный Центр http://ponkc.com/about/
Oftalmic http://oftalmic.ru/
Клиника Репродукции и Генетики NGC http://www.spbivf.com/
Genetico http://genetico.ru
КНОМИКС http://knomics.ru
Институт стволовых клеток человека (ПАО «ИСКЧ») http://www.hsci.ru/
ИнтерЛабСервис http://www.interlabservice.ru/
Лаборатория биоинформатики ФГБУН НИИ ФХМ ФМБА России http://niifhm.ru/nauchnye-issledovanija/otdel-mole...
Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича http://www.ibmc.msk.ru/
Биомедицинский холдинг «Атлас» https://atlas.ru/gentest
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук (ИМБ РАН) http://www.eimb.ru/rus/structura/churikov.php
Медико-генетический научный центр http://www.med-gen.ru/
Учебно-Научный центр "Биоинформатика" ИППИ РАН http://www.rtcb.iitp.ru/index_r.htm
Лаборатория системной биологии МФТИ http://pharmcluster.ru/labs/systems-biology/
Лаборатория сравнительной и функциональной геномики ИБХ РАН http://www.ibch.ru/ru/structure/groups/lcfg
Лаборатория эволюционной геномики факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ им. М.В. Ломоносова http://evolgenomics.fbb.msu.ru/
Center for Data-Intensive Biomedicine and Biotechnology, Skoltech http://crei.skoltech.ru/cdib/education-2/
Генотек http://www.genotek.ru/
Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В.И. Кулакова (НЦАГиП) http://www.ncagip.ru
Гематологический научный центр РАМН http://www.blood.ru/
НИИ Физико-химической биологии имени А.Н. Белозерского http://www.belozersky.msu.ru/
Лаборатория системной биологии МФТИ(ГУ) http://mipt.ru/dbmp
iBinom https://www.ibinom.com
GERO http://gero.com
BIOCAD http://biocad.ru

Новосибирск
ЦКП «Геномика» СО РАН http://sequest.niboch.nsc.ru
Biosoft http://biosoft.ru/ru/
UNIPRO http://unipro.ru

Санкт-Петербург
ЗАО «НПП ТЕЛДА» http://www.telda.ru
Лаборатория системной биологии и биоинформатики СПбГПУ http://amd.stu.neva.ru/laboratory/systems-biology-...
Genestack https://genestack.com/
Лаборатория биоинформатики в Санкт-Петербургском государственном политехническом университете https://science.spbstu.ru/news/novost-ot-podrazdel...
Центр биоинформатики и алгоритмической биотехнологии, СПбГУ http://cab.spbu.ru/
Лаборатория «Структурная биоинформатика», ИТМО http://irc.ifmo.ru/ru/87813/
Лаборатория «Компьютерные технологии» ИТМО http://irc.ifmo.ru/ru/87845/
Parseq Lab http://www.parseq.pro
Центр геномной биоинформатики СПбГУ http://dobzhanskycenter.bio.spbu.ru
Лаборатория алгоритмической биологии, СПбАУ РАН http://bioinf.spbau.ru
Институт биоинформатики http://bioinformaticsinstitute.ru

Мир
EPAM https://www.epam-group.ru
PSI CRO http://www.psi-cro.com/
Center for Human Genetics http://gbiomed.kuleuven.be/apps/cme/index.html?en
European Molecular Biology Laboratory http://www.embl.de/
Германия Research Laboratory of Experimental Immunology at DRFZ (Berlin) http://www.drfz.de/en/experimentelle-immunologie/
Германия geneXplain http://www.genexplain.com
Сингапур SingHealth Translational Immunology and Inflammation Centre (Singapore) http://research.singhealth.com.sg/Pages/stiic.aspx
США Northwestern University, Chicago, USA http://www.medicine.northwestern.edu/divisions/pul...
США InSilico Medicine http://insilicomedicine.com/
Франция Bonsai Bioinformatics group, University of Lille, France http://www.cristal.univ-lille.fr/bonsai
Чехия Department of Biology and Ecology, Faculty of Science, University of Ostrava, Czech Republic http://prf.osu.eu/kbe/
Швейцария IBM Zurich Research Laboratory http://www.zurich.ibm.com/